Quando for declarar as cotas do Fundo, o correto é informar o CNPJ do fundo e não do administrador do fundo. Já no caso de rendimentos recebidos de um FII, o nome e o CNPJ da fonte pagadora, são os do administrador.
Exemplo: Na tela abaixo, temos o FII ALZR11 que é administrado pela BTG Pactual. Quando a pessoa for declarar os rendimentos recebidos desse fundo, deve-se informar o nome e CNPJ destacados em amarelo, do administrador. Porém, no momento de declarar as cotas desse fundo no quadro de bens e direitos, é necessário informar o CNPJ do próprio fundo, destacado em vermelho.