Sim. As bonificações, apesar de serem incorporadas sem uma liquidação financeira, podem ter custo. Depende da decisão na Assembleia que deliberou a bonificação. É importante ler a Ata da Assembleia para ver se a bonificação teve o custo atribuído. Se tiver, você pode lançar o valor como custo das ações recebidas. Veja o que diz a IN 1585 de 2015: 

Art. 58. Nos mercados à vista, o ganho líquido será constituído pela diferença positiva entre o valor de alienação do ativo e o seu custo de aquisição, calculado pela média ponderada dos custos unitários.

§ 1º No caso de ações recebidas em bonificação, em virtude de incorporação ao capital social da pessoa jurídica de lucros ou reservas constituídas com esses lucros, considera-se custo de aquisição da participação o valor do lucro ou reserva capitalizado que corresponder ao acionista ou sócio, independentemente da forma de tributação adotada pela empresa.

Nesse tipo de bonificação é como se você tivesse recebido a bonificação em dinheiro e adquirido mais ações por subscrição.