Se você importa notas de corretagem via PDF, no final do processo o sistema trará esta mensagem:

Ao ler o arquivo, o sistema informará o total de notas no arquivo, a quantidade de notas integradas e a quantidade de notas ignoradas.

No caso acima o arquivo tinha apenas uma nota e ela foi integrada. Mas se ainda quiser saber se ela realmente está no sistema, acesse o menu: Relatórios > Ações > Notas de Corretagem no Mês (se a nota for bovespa) ou para Futuros acesse o menu:  Relatórios > Futuros > Notas de corretagem resumida (se a nota for BMF).

Na tela que abrir, basta selecionar o mês e o ano e clicar no ícone do PDF para abrir o relatório. Essa conferência também pode ser realizada caso você tenha suas notas integradas diretamente da corretora.

Se a nota estiver nesse relatório, ela estará integrada no sistema. Caso não esteja, tente reintegrar o arquivo e fazer uma nova conferência.